六月二十三日（8月10日），孙家鼐接到了总署《为义国（即意大利）公使荐义国教习事咨大学堂》公文及抄件《义萨署使来照会》，《照会》声言：“……该《章程》各国言语教习内，并未载义国言语教习，此系遗忘无疑。义国之言，诸国中之最古最佳者也。……将来除英、俄、德等国言语之外，仍教义言，并请义师教授。”
一周后，总署又转过来德国公使海靖的照会。
海靖刚到中国赴任时，音译名字叫“海静”，恭亲王首次接见他时，就一本正经地说：“你到大清来是为了两国友好，而你的名字旁边有个争字，不太吉利。我想为你改个名字，叫‘靖’可否？”海靖很爽快地答应了。恭亲王颇为得意。谁知外国人对音译名字，根本就不当一回事。后来，中德发生争端，海靖吹胡子瞪眼，态度暴烈，遇事必争，总署官员听说海靖来交涉，几乎是谈“靖”色变，能躲就躲，退让三分。
海靖对中国人评价不高，他认为“最好的思想、计划、设施和工具，一旦经中国人插手管理，立即会化为齑粉，并被玷污”。尽管如此，他在《照会》里，还是首先肯定了创建京师大学堂的意义：“在京师建立大学堂，实属育才兴学之举。本大臣钦佩莫名。想此实系中国自开富强之路。”接着，他对教习分配方案表示不满：“第五章第三节内，定设英文分教习十二人，英人、华人各六。德国分教习一人，或用德人，或用华人……查如此布置，实于均称相抵之道大有不符之处，且于中国国体自主权大有妨碍……因此，不得以学校偏重英国，使其余各国向隅。中国常操自主之权在手，平交各大国。设今仅使一国把握利权，未免棘手，不得允许……天下各国学校，德国为首，他国不能并论……且于前年李中堂游历各国旋京时，初见本大臣之际，即称赞德国学校大可仿照。”最后，海靖提出了“瓜分”西学教习名额的要求：“如各国文学共设教习十五人，均系五大国之人。若聘请德国教习三人，如此方为公允。又查，该《章程》内定，专门学校十种分教习各一人，共十人。内亦须聘请德国人二人。”
孙家鼐当然知道，弱国无外交。两个照会，一唱一和，事关中外关系，处理得稍微不慎，就会引发国际纠纷。同意他们的无理要求，中国的教育主权就会受到损害；如果拒绝，他们岂能善罢甘休？经过10天的深思熟虑，七月初十（8月26日），孙家鼐在《拟拒德、意自荐教习咨复总署》中旗帜鲜明地答复道：“查中国开设大学堂乃中国内政，与通商事体不同，岂能比较一律。德国、意国大臣似不应于干预。相应移复贵衙门可也。”