2000年10月，被“世界经济论坛”评为2001年全球100位“未来领袖”之一；美国亚洲商业协会评选他为2001年度“商业领袖”;
2002年5月，获选成为日本最大财经杂志《日经》的封面人物；
2004年12月，荣获CCTV十大年度经济人物奖；
2008年3月，获选巴隆金融周刊2008年度全球30位最佳运行长；
2008年7月，获得日本第十届企业家大奖。该奖项过去只颁发给日本国内的企业家；
2008年9月，获选美国《商业周刊》评出的25位互联网业最具影响力的人物。他也是唯一上榜的中国企业家；
2009年，在马云45岁时，个人净资产达80亿，位列胡润富豪榜第77位；
2009年11月，获选《时代》2009年百大最具影响力人物；2009年11月，获选《商业周刊》2009中国最具影响力40人；
2009年12月23日，获选CCTV中国经济年度人物中国经济十年商业领袖十人之一；
2010年9月，《财富》杂志以“智慧”和“影响力”为指标，评选出当今全球科技界最聪明的50人。马云以“阿里巴巴CEO”身份入围“最聪明CEO”第四名，颁奖词为“阿里巴巴的帝国正在向全球快速扩展”。
2012年《财富》中国最具影响力的50位商界领袖排行榜，马云榜上有名，排名第八……
国家形象人物
2010年7月，国务院新闻办公室正式启动了《国家形象系列宣传片》的拍摄工作。马云作为参演人员，入选2010年《中国国家形象宣传片》人物。该片是为塑造和提升中国繁荣发展、民主进步、文明开放、和平和谐的国家形象而设立的重点项目，是在新时期探索对外传播新形式的一次有益尝试。据悉，此次先期启动的国家形象宣传片委托全球知名广告公司制作，节目包括时长15分钟的专题长片和30秒广告短片，15分钟专题片，以“以人为本、科学发展”的理念为核心，涉及政治、经济、社会、文化、科研、教育、环境、民族等多个领域，拍摄地点分布各地，力图多角度、全景式地展示当代中国的建设成就，弘扬积极向上的当代中国精神。30秒广告短片采用更有冲击力和震撼力的方案，集中了体育界、演艺界、学术界、科技界、企业界等享有国际盛誉的优秀中华儿女，力图展现当代中国生机勃勃的国家形象。