曾经两度访问中国的霍金已经深深爱上了中国这片土地，长城的宏伟给予了他强烈的震撼，西湖的美景也曾经让他流连忘返，而霍金与中国的缘分似乎还在继续。4年之后，也就是2006年，霍金再次进行了中国之旅。
超弦国际会议即将在北京召开，霍金受邀参加。6月12日，霍金首先来到中国香港，在香港科技大学逗留了四天。此次陪同霍金前来的是他的女儿露西，当时霍金与妻子伊莱恩出现了一些矛盾，所以没有陪同前来。
和往常一样，霍金的行程虽然紧迫，但是依然要游览当地的风光。霍金得知香港的夜景有着独特的辉煌璀璨，于是在香港科技大学做了一番学术研讨和演讲之后，乘船穿梭在香港的万家灯火之中。这让他感到星空般的闪耀，他称赞香港是一个充满活力并且非常时尚的城市。
6月15日，香港特区行政长官曾荫权在礼宾府会见了霍金。之后，霍金又回到科技大学，并且进行了一次科普演讲，此次演讲的题目为“宇宙的起源”，因为是科普知识，所以演讲的内容较为通俗易懂，会议大厅足有1800名听众，所有人都热情高涨。
演讲的开篇是一个童话，同于西方国家上帝创造万物的古老传说，此次的演讲也是围绕“我们为何在此，又是从何而来？”的问题展开的。按照霍金的理解，人类起源应该不是太久远，因为自人类出现开始，就不断进化和发展，一些辅助因素，比如科学和技术也在蓬勃发展，若是人类早就出现了，那人类应该比现在要先进得多。
与詹姆·哈特尔的理论有些相似，霍金的理论也可以看成宇宙的出现就如同泡泡在沸水中形成的过程，而宇宙就相当于泡泡的表面。但是，泡泡会越来越膨胀，而膨胀的结果就是最终会暴胀，对应到宇宙，就称之为坍塌。即便可以维持一段时间，也许会衍生出一些星系和恒星，但并不可能出现智慧的生命。当然，这些只是小泡泡所代表的微小宇宙，也有一些泡泡能够膨胀到一定的尺度，不会轻易地暴胀，然后在这个基础上不断膨胀，才形成了我们所能看到的泡泡，也就是今天的宇宙。
也就是说，现在的宇宙就如同一个正在加速膨胀的泡泡，它随时都有可能会坍塌，这就使得科学家们对宇宙的未来担忧起来。此前一段时间，宇宙的膨胀速度缓慢下来，但是现在又开始加速了。宇宙是否会继续膨胀？而膨胀的结果必然是暴胀吗？或者说人类现在所处的宇宙会不会在某一个时点最终坍塌？这些都是充满神秘感的东西，宇宙学总是令人非常激动，没有什么比研究自己的过去和未来更值得期待的了。
演讲的最后是记者提问时间，霍金高兴而幽默地回答着五花八门的问题，脸上时不时地露出纯真的笑容，他的幽默也使得台下的观众发出阵阵笑声。
霍金一直保持着积极乐观的人生态度，当时有一位记者向霍金问道：“有一位年轻的瘫痪病人，他受不了从此失去行动能力的打击，所以希望能够安乐死。您会为您的身体残障而感到沮丧吗？面对生活中的负面情绪，您又是如何克服的呢？”
霍金淡然一笑：“人有权利左右自己的生死，他也可以自由选择，但死却是一个错误的选择。命运有好有坏，也许自己无法左右命运，但是自己可以创造生命的价值，有生命就会有希望。”
一些老生常谈的道理大家再明白不过了，但当这番话由一个深受命运摧残的人说出，便包含了发人深省的意味。
在演讲会议的尾声中，来自香港大学、香港科学学会以及香港物理学会的40多名学者们与霍金欢聚一堂，再次欢迎霍金的到来，庆祝此次演讲圆满结束，霍金也接受了物理学会赠书《物易星移》。
6月17日，霍金乘坐飞机抵达北京，出席超弦国际会议。在北京的两场讲座中，霍金演讲的题目都是“宇宙的起源”。霍金在中国的影响逐渐增强，一股“霍金热”之风正在悄然刮起。
中国的“霍金热”使得霍金在人民大会堂上创造了国际之最——人民大会堂上下两层全都坐满了人，总数超过了6000人。这里面有600位科学家、科研工作者和高校学生，而大多数则是普通市民。这次演讲会创造了国际物理学术讲演会听众人数之最。
在超弦国际会议上演讲的专家学者来自世界各地，霍金被安排在最后一个出场。临近中午，霍金坐在智能轮椅上，由助手推着出场，全场爆发出了热烈的掌声，二楼的听众站起身向霍金致意，而一楼的听众则纷纷上前拿起相机为霍金拍照，全场听众的热情开始高涨。在丘成桐教授的安排下，听众们才抚平激动的心情，纷纷回到座位上。整个过程，霍金都礼貌地微笑着，全场安静下来之后，霍金的演讲正式开始，而这距他来到主席台上，已经过去了十分钟。
演讲的题目仍然是“宇宙的起源”，霍金使用语音合成器进行演讲，在演讲过程中，霍金那充满美国口音的声音高亢嘹亮，霍金的科研团队也精心制作了对应演讲的幻灯片，使整个演讲的内容令听众震撼不已。
6月21日，霍金出席科技发展公众答询会，地点在友谊宾馆。在答询会上，记者共提出了9个问题，霍金在当场作出了答复。
这些问题中，大多是询问霍金对于中国的看法以及关于宇宙的问题。霍金表示他对中国感兴趣的是五花八门的食物和多姿多彩的文化，当然也有仪态万千的女性；对于经济发展下的环境污染，霍金深表遗憾，他认为以环境为代价的发展是不值得提倡的；有关宇宙，大家还是比较关注起源的问题，而霍金则说道：“宇宙之所以存在，是因为我们提出了一个有关它存在的理论，并且正在努力寻找可以证明这一理论的证据。这就是说，如果这个关于宇宙的理论被证明是不存在的，那么宇宙也就消失了。”有人问霍金是否还有什么愿望没有实现，霍金表示：“愿望就像梦想，也可以看作是生活的目标核动力，一个人若是没有梦想，那只能说他只是肉体在活着。”很多人都想知道霍金对自己的评价，霍金风趣地做出了这样的回答：“乐观、浪漫，有时候顽固不化。”
最后一个问题是现场的观众——清华大学的学生成千业提出来的，问题是：“2005年，格罗斯教授提出了物理界要解决的25个问题，您认为物理界最重要的问题是什么？”
对于这个问题，霍金需要认真地思考一番，他双眼紧盯语音合成器的液晶屏幕，沉思了将近8分钟，才得出了一个比较全面的答案，听众们在连接语音合成器的翻译下听到了这样的回答：“物理学最重要的问题是如何理解宇宙，理解宇宙为什么是这个样子，怎样变成这个样子，这就需要量子理论的条件。”
6月23日，霍金在北京做了最后一场演讲，此次演讲的题目是“宇宙的半径点膨胀模型”，这个课题有着很强的学术性，面对的人群也是物理学界的顶级学者。
演讲接近尾声的时候，格罗斯教授作为会议主持人向大家表示，霍金由于身体原因不便回答提问，但还是有热衷于宇宙的听众问出了相关问题，对于这些专业性问题，霍金回答道：“在宇宙半径点的模型中，宇宙的爆炸和膨胀依靠着宇宙所具有的膨胀能量，物质将会填充整个空间。”
第三次中国之行也接近尾声了，霍金这位“宇宙之王”的高大形象已经深深印在了中国民众的心里。从香港开始，“霍金热”就在中国迅速蔓延，他的著作也被译成中文广为传播。香港科技大学的校长朱经武也表示：“霍金的一言一行都备受瞩目，他的到来触发了香港年青一代对于科学的重视……当然，这种精神有着很大的激励作用，有了‘霍金精神’，那么一切都皆有可能。”
6月24日，霍金一行提前两个小时到达首都机场的贵宾通道。在这里，霍金回答了记者问到的第三次中国之行的感想，霍金面露微笑，语音合成器发出他愉快和不舍的声音：“我很喜欢这次中国之行。”助理莫妮卡也抓着霍金的手同记者握手。中午11点整，飞机起飞，霍金结束了第三次中国之行，回到了英国。
丘成桐教授对记者说：“霍金的身体不是很好，这或许是他最后一次来中国了吧。”
霍金与中国结下了深厚的渊源，只是不知道这份缘分是否能有下一次。但是席卷中国的“霍金热”让中国民众记住了这位伟大的科学家，还有那句话：永远都不要绝望。