可是，意大利仍不死心，七月二十二日（9月7日），萨署公使专程到总署交涉，要求负责接待的总署大臣张荫桓立即向光绪皇帝转达他们的抗议。迟迟未见结果时，他又于八月初八（9月23日）发来一个措词更加严厉的《照会》：
新开学堂，华士学习西洋学课，今切不可废置义文、免用义国教习。义国原属近世学文之兴起之国。万国内法、天文、格致等类，均系义人开创。华人非不知其事。古时聘用出名义师如利玛窦等人，勉力大利于中国兴起学问，而不知此事者，便为老年传教、并无学问之人，实未得欧洲开教之据。此人前次误派同文馆，因其无能，则同文馆创设多年，至今并无成效之势。兹又闻此人管理新设大学堂。查原编辑学堂章程者遗忘义国。本署大臣提及此误，仍请总署管学大臣添改《章程》，……如不将外国大臣之请奏明，此事即违背大皇帝之谕旨，……不论精益求精，而竟倚仗在先之管理同文馆者，甚惧将来仍系绝无成效。总署已接他馆照会，便可知悉。北京洋人无不甚诧，因何中国专派斯人管理大学堂。其人虽庄严恭敬，而实无一能，何能管理大皇帝专心关系之事？”
这一照会，再次指名道姓地对丁韪良进行人身攻击。
接到这个《照会》时，慈禧已在开杀戒，北京城时已陷入白色恐怖之中。孙家鼐却大义凛然，接到总署转来的《照会》第二天，他就义正词严地答复：
查本大臣办理大学堂，皆遵照贵衙门原奏章程，期于中外交涉语言文字相通而已，非必各国皆有教习也。且中外交涉者，共十余国。若各国皆荐教习，贵衙门何以应之？仍请贵衙门斟酌回复可也。⑶
遥想当年，清政府“外战外行、内战内行”，对西方列强、东方“土豪”（日本）俯首帖耳，极尽谄媚之能事，孙家鼐却在“新法悉罢，独留家鼐为管学大臣，刚毅、徐桐嫉之，时相齿+奇齿+乞（yihe，意为陷害、倾轧）”⑷之时，为捍卫中国的主权，对列强的无理要求一再说“不”，其民族气节、爱国情怀真是无需言表、可敬可佩！
注释：
⑴孙家鼐：《奏覆筹办大学堂情形折》，中国史学会编：《戊戌变法》（第二册），神州国光社，1953年版，第435—437页。
⑵吴汝纶：《致廉惠卿》，《吴挚甫尺牍》（第二卷），国学扶轮社，1910年版，第16页。
⑶孙家鼐：《为意国大使荐教习事咨复总理衙门》，国家档案局明清档案馆编：《戊戌变法档案史料》，中华书局，1958年版，第15页。
⑷高拜石：《新编古春风楼琐记》（第十三集），作家出版社，2005年版，第364页。