梅贻琦冒着风险，再度乘车进城与当局斡旋。同时紧急拍发密电给南京行政院秘书长翁文灏和政务处长蒋廷黻，请他们施以援手。
据清华外语系教授叶公超凭借与梅贻琦多年共事的经验，认为梅贻琦是一个传统的中国人，其性格是慢、稳、刚，但这个“慢”有时颇令人着急。叶公超举例说：宋哲元派兵到清华去逮捕共产分子这件事，事前我们就得到了消息，当时叶企孙、陈岱孙、冯友兰、张奚若等和我，都在梅宅商量如何应付这桩事。“事情紧急，几乎每个人都说了许多话，惟有梅先生自己默默不发一言，大家都等他说话，足足有两三分钟之久，他老先生还是抽着烟一句话不说。结巴的冯芝生最后就向梅先生说：‘校长你——你你看怎么样？’梅先生还是不说话。我就忍不住了，我说：‘校长，您还是没有意见而不说话，还是在想着而不说话？’梅先生隔了几秒钟答复我：‘我在想，现在我们要阻止他们来是不可能的，我们现在只可以想想如何减少他们来了之后的**。’有人问：‘究竟有多少人会来？什么时候来？’梅先生说：‘都不知道。……我看，来是不成问题的了。’后来还是梅先生把校内的安排作了一个最后的决定。”
叶公超所举事例没有说明商谈的具体时间，但据后来的资料推断当在天黑之前。面对“酒兵易压愁城破”的艰危处境，梅贻琦当时心情之沉重，考虑之周密，处理之慎重由此可见。此点正如梅贻琦对清华校友刘崇鋐所言：“我受的科学训练，教的也是科学，有时处理事情谨慎一点慢一点，也许就是因为我的科学观念，叫我不肯随便。”
叶公超评价梅性格中“慢、稳、刚”所得出的结论正应了梅贻琦这段话。叶公超说：“我认识的人里头，说话最慢最少的人，就是他和赵太侔两个人。陈寅恪先生有一次对我说：‘假使一个政府的法令，可以和梅先生说话那样谨严，那样少，那个政府就是最理想的。’因为他说话少而严谨，他作事和作人也就特别的严谨。天津话叫‘吃稳’，梅先生可以说当之无愧。”
梅贻琦对军警压境所做决定和处理经过，《清华大学校史稿》没有一字提及，倒是几位当年的亲历者披露了一些隐秘，如华道一回忆说：“这天下午，当大批军警围困清华大学扬言要冲进校内的紧张时刻，我作为当时学生救国委员会的委员，曾和其他几位委员一起到梅校长住宅访问。梅校长在他家接待了我们。我记得当时梅校长对学生是十分爱护、关怀的。他说，现在局势很紧张，军警可能要冲进校内来，希望有被捕危险的同学要设法避一避。在我的记忆里，当时梅校长曾交给我们一个名单，说是军方交给学校要求逮捕的，这个名单上列名的同学约有二十余人。我们从梅校长家出来，已将天黑，大家就按校长的话，设法躲避。我自己是躲在叶公超教授家里，像姚依林当时躲在冯友兰教授家里，这在近几年来已屡见报刊，传为一时佳话了。从这一件事看来，梅校长当时作为国民党政府特任的国立大学校长，能冒着一定风险，如此保护学生，应该说是十分难得的。”
华道一的回忆大体可信，因为名单上的主要分子，基本在当天夜里得以躲避而幸免被捕。
大逮捕风潮过后，梅贻琦对新闻界发表谈话说：“敝校风潮刚刚平息，又发生了这样的事，实属不幸之至。……学校对此，惟盼当局早日分析清楚，能早将无关系者保释回校……至于被捣毁车辆，当局如无严苛条件提出，校方为平息事件，可给予相当赔偿费，否则学校不负此责任。”
梅贻琦讲话使事件各方情绪得到缓和，但是清华内部的隐患却没有消除。
接下来，一个疑问萦绕在每个同学心中：军警特工人员是如何得到“不法分子”名单的？提供这个名单的是何人？在众人疑虑与相互质询猜测中，有学生认为此人非教务长潘光旦莫属，因为他最有条件，也最可疑。于是，部分学生头目便有了教训潘光旦的行动。
果然，第二天一早，潘光旦就遭到了“救国会”部分学生的围攻。当时的亲历者林从敏回忆说：“我到达校门时，在警卫室的北面，潘先生的两个拐杖已经被丢在地上，他用一条腿边站边跳来保持平衡。我与级友方鉅成赶紧去左右扶持他，将拐杖拾起，陪着他走到大礼堂台阶上。这时前后还是有人呼喊，但并未动手来打，潘先生头发凌乱，却面带笑容。这时候从科学馆方向慢步走来了梅校长。梅师穿着一件深灰长袍，登上礼堂台阶后，站在潘教授之旁，面对着二三百同学，有半分钟未发一言，显然是尽量的在抑制他的愠怒。那些夹在人丛中呼喊推打的同学都安静下来。最后梅校长发言了，‘你们要打人，来打我好啦！你们如果认为学校把名单交给外面的人，那是由我负责。’我们记得某学长戏作打油诗一首，描述校长说话谦逊含蓄情形‘大概或者也许是，不过我们不敢说，可是学校总以为，恐怕仿佛不见得’。但是在推打潘先生这一天梅师坚定果断，毫不含糊其辞。这是我们第一次见到梅师表现他在‘危机’情况下，当机立断处事的精神。”
林从敏的回忆并非孤证，当时的学生徐贤修也亲临现场并有过与林类似的回忆，他说：梅校长看到有学生夺去潘光旦的拐杖，挺身而出，痛心疾首地说：“在清华竟出现这样野蛮的行动，我万分痛心，你们一定要发泄闷气的话，来打我好了。不然如果你们还有理智良知，就应该听从学校的处理，我以校长的身份，来处理这件事，自然有公平的办法。”话音落地，叮当有金石声，几个吹胡子瞪眼极尽煽动蛊惑之能事、恶意抢夺拐杖的学生立马蔫了，部分学生露出羞愧之色，另一部分围观性质的学生则振臂高呼：“拥护梅校长！”此举令在场的徐贤修为之动容。
那个时期社会动**，清华校长连年更迭，学校很不稳定，校长很少有作得长久的，但自从梅贻琦掌校后，就一直安定下来了。