造成身体出现亚健康状态的原因是复杂多样的，主要有以下几个方面。
(1)过度疲劳造成的精力、体力透支。由于竞争的日趋激烈，人们用心、用脑过度，身体的主要器官长期处于入不敷出的非正常负荷状态。关于这点我们在其他章节还会谈及。
(2)情绪低落以及心理障碍，也会出现亚健康状态。
(3)心理失衡。一般认为，出现亚健康状态心因常起主导作用，古人云：万事劳其行，百忧撼其心。高度激烈的竞争，错综复杂的各种关系，使人思虑过度，不仅会引起睡眠不良，甚至会影响人体的神经体液调节和内分泌调节，进而影响机体各系统的正常生理功能。
(4)饮食不合理。当机体摄入的热量过多或某种必需的营养贫乏时，都可导致机体失调。
(5)环境恶化：①噪音。②空调。高层建筑林立，房间封闭，一年四季使用空调，长期处于这种环境当中，空气中的负氧离子浓度较低，影响人体组织细胞正常的生理功能。③环境污染。④长期接触有毒物品等。⑤气候影响。
(6)其他。如锻炼不当、乱用药品、外伤劳损、睡眠不足、缺少运动等，也可出现亚健康状态。